空間オミクス解析スタートアップ実践ガイド(実験医学別冊　最強のステップUPシリーズ) [単行本]

空間オミクス解析スタートアップ実践ガイド(実験医学別冊　最強のステップUPシリーズ) の 商品概要

• 目次

  【目次】
  序―配列からバイオロジーへ
  空間オミクス解析への期待
  “使う”時代がやってきた
  概論 空間オミクス解析の技術レビューと機器・データ解析ツール選択ガイド
  
  ◆ 実践編
  第1章 技術とプロトコール
  1 空間トランスクリプトーム Visiumによる新鮮凍結／FFPE組織検体の解析
  2 空間トランスクリプトーム Visium のデータ解析ツール
  3 空間トランスクリプトーム ロングリードシークエンスを用いたscRNA-seqおよびVisiumの全⻑cDNA解析
  4 空間トランスクリプトーム 深層学習を活用したVisium測定結果の超解像度化
  5 空間トランスクリプトーム Xenium In Situ
  6 空間トランスクリプトーム HybISS（Hybridization-based in situ sequencing）
  7 空間トランスクリプトーム Stereo-Seq（STOmics）
  column ROI組織パンチングによる空間的遺伝子発現解析
  column セミバルクRNA-seq
  8 空間プロテオーム Hyperion Imaging Systemを用いた多重イメージングマスサイトメトリー
  9 空間プロテオーム PhenoCyclerを用いた多重蛍光免疫染色
  10 空間プロテオーム（空間トランスクリプトームも可能） GeoMxを用いたがん組織のマルチタンパク質発現解析
  11 空間メタボローム メタボロームと時空間オミクスの融合とイメージングマス
  
  第2章 データベース
  12 バイオイメージングデータベースの現状と展望
  13 遺伝子発現データベースを活用した空間・発生解析
  
  ◆ 応用研究編
  第1章 発展的空間オミクス解析
  1 空間オミクス解析を補う1細胞トランスクリプトーム技術の最前線
  2 空間トランスクリプトームと1細胞トランスクリプトームの統合解析
  3 空間トランスクリプトームに基づく細胞間相互作用ネットワークの解析技術
  4 セルオミクスによる臓器・全身の空間コンテキスト解析
  5 イメージングによるオミクス状態の推定
  
  第2章 活用例と展望
  6 免疫研究と空間オミクス解析
  7 空間トランスクリプトームを用いた感染症研究の芽生え
  8 心臓血管疾患と空間オミクス解析
  9 がん免疫研究におけるシングル細胞解析と空間解析への展開
  10 精神医学研究におけるゲノム解析と空間トランスクリプトームの現状
  
  索引

• 出版社からのコメント

  劇的な進化を遂げる空間オミクス解析のいまがわかる！

• 内容紹介

  シングルセル解析の弱点「位置情報の損失」を補う新技術は，実際どこまで使えるのか?! 次々に開発される機器のそれぞれの特徴とプロトコール，さらに応用例と今後の技術展望まで，最先端の情報を凝縮した1冊．

空間オミクス解析スタートアップ実践ガイド(実験医学別冊　最強のステップUPシリーズ) の商品スペック